港区でフリースクールを探している方へ。お子さんが学校に行きづらくなったとき、「家の近くに通える場所はあるのか」「費用はどれくらいかかるのか」が最初の心配ごとだと思います。
この記事では、港区 フリースクールの選択肢を、南麻布・高輪・北青山・六本木など区内の施設5か所と、隣の品川区からアクセスしやすい施設2か所、あわせて7か所紹介します。
順位づけはせず、公式サイトで確認できた情報だけをフラットにまとめました。あわせて、都と区あわせて補助金として最大月4万円が支給される利用料助成についても解説します。
自己紹介が遅れました。小幡和輝と申します。僕は不登校の元当事者です。約10年間学校に行かず、フリースクールで学びました。現在は不登校の専門家として、本の執筆や講演をしながら、2000人以上の子どもたちとご家庭をサポートしています。
港区の不登校の状況と補助金
東京都の調査では、都内公立小中学校の不登校の児童生徒は令和6年度で31,335人（小学生13,296人・中学生18,039人）でした。港区も例外ではなく、区は相談窓口や学びの場の整備を進めています。
都と区あわせて補助金として最大月4万円
港区在住の方は、フリースクールの利用料に対して2つの助成を重ねて使える可能性があります。
- 東京都フリースクール等利用者支援事業 都内在住の不登校の小中学生の保護者に、利用料の助成として月2万円を上限に支給されます。所得制限はありません。令和8年度も実施されています。
東京都フリースクール等利用者支援事業の公式ページ - 港区フリースクール等利用料助成金 都の助成金の交付決定を受けている区内在住の児童・生徒の保護者に、区が独自に上乗せする制度です。利用料の2分の1から都の助成分を差し引いた額が、月2万円を上限に支給されます。令和8年度の申請は2026年9月1日から2027年3月31日までで、期間ごとに申請できる時期が異なります。問い合わせは教育人事企画課教育支援係（03-5422-1541）です。
港区フリースクール等利用料助成金の公式ページ
つまり、都と区の両方の要件を満たせば、補助金として最大で月4万円まで支給されます。23区の中でも手厚い水準です。年度ごとに内容が変わることがあるので、最新情報は必ず公式ページでご確認ください。
申請の流れや、実際に補助金と出席扱いをどう組み合わせるかは、こちらの記事で詳しく解説しています。
>>【実例あり】港区で不登校の出席扱いが認められた方法。補助金は都と区あわせて月最大4万円
区の公的な支援
フリースクール以外の公的な選択肢もあります。
- 教育支援センター つばさ教室（北青山1-1-9、03-5422-1548） 区内在住の小中学生が対象で、月〜金の8:45〜16:00に利用できます
- 学びの多様化学校 Minato School（虎ノ門3-6-9、03-3578-3240） 継続して30日以上登校できない中学生を対象にした、不登校の子のための学校です
- 教育センターの教育相談（03-5422-1545） 対面・オンラインで相談できます
区の支援の全体像は東京都の不登校支援ポータルにまとまっています。
区の公的な支援の公式ページ
フリースクールは出席扱いになる？
フリースクールでの学びは、在籍校の校長が認めれば指導要録上の出席扱いになりえます。文部科学省が通知で要件を示しており、学校とフリースクールが連携していることなどがポイントです。
出典: フリースクールは出席扱いになる？
港区での出席扱いの実例と手続きの進め方は、先ほどの記事にまとめているので、検討中の方はあわせてお読みください。
まだ外に出るのが難しい、近くに通える場所がないという方へ
通える場所を調べる前に、知っておいてほしいことがあります。学校に行きづらくなった直後は、家から出るエネルギーそのものがまだ戻っていない時期があります。この段階で通う場所を無理に決める必要はありません。
そういうときの選択肢として、オンラインフリースクール「クラスジャパン小中学園」があります。ネットの先生（担任）が一人ひとりに伴走し、自宅から自分のペースで学べます。
2018年の開校から、これまでに2000人以上の不登校の子どもたちを支えてきました。一定の要件を満たせば在籍校の出席扱いになる仕組みも整っています。
学習AIがヒントを出しながら一緒に考えてくれて、学習以外に使えないフィルタリング設定があるので、ゲームや動画が心配な方も安心です。
港区のフリースクール一覧
港区内の施設5か所と、隣接する品川区からアクセスしやすい施設2か所を紹介します。順位をつけたものではありません。東京都の令和7年度の助成対象施設一覧（公的な一覧）に掲載されている施設を中心に、公式サイトで実在と所在地を確認したものだけを載せています。
ビリーバーズ広尾（南麻布）
小中高生のくつろぎスペース ビリーバーズ広尾
運営: 一般社団法人ビリーバーズ
所在地: 港区南麻布5-3-20 有栖川ビル2F
対象年齢: 小学生〜高校生
料金: 入会金なしのチケット制（単発6,900円、5回31,800円、10回52,000円、月額通い放題62,500円。体験7,700円）
広尾駅そば、有栖川宮記念公園近くの「くつろぎスペース」型フリースクール。平日10:00〜14:00に開所し、入会金のない回数チケット制なので、子どもの調子に合わせて利用ペースを変えられます。都の助成対象一覧にも掲載されています。
GIFT School（北青山）
GIFT School
運営: 一般社団法人GIFT Project
所在地: 港区北青山2-7-25 神宮外苑ビル6階
対象年齢: 3歳〜15歳
料金: 要お問い合わせ
神宮外苑エリアにある定員30名のマイクロスクール。3歳から15歳までの子どもたちが異年齢で一緒に過ごし、個別・ペア・グループとかたちを変えながら、興味から出発する学びをつくっていくオルタナティブスクールです。不登校の子の学習支援と居場所づくりも行っています。
ピットリーフリースクール（高輪）
ピットリーフリースクール
運営: 要お問い合わせ
所在地: 港区高輪3-7-8 西町ビル3B
対象年齢: 小学1年生〜中学3年生
料金: 要お問い合わせ
内向的で繊細な子のための少人数制フリースクール。「心を育ててから学びへつなぐ」を大切にしていて、机の学習だけでなく社会体験や自然活動、特別講師を招いた学びを取り入れています。開所は月〜金の9:00〜15:00です。
ワイズアカデミー品川キャンパス（高輪）
ワイズアカデミー 品川キャンパス
運営: 株式会社ワイズアカデミー
所在地: 港区高輪4-11-24 ヒルズ高輪A-302
対象年齢: 中学生
料金: 年間33万円（月27,500円の分割可）
品川駅から徒歩3分の中学生向けフリースクール。登校・下校の時間が自由で、週1日から自分のペースで通えます。在籍校の教科書やワークを使った個別型の学習支援が特徴で、高校生向けの通信制サポート校が併設されているため、中高一貫で同じ場所に通い続けられます。
コクーンアカデミア（六本木）
コクーンアカデミア
運営: 株式会社スタディラボ
所在地: 港区六本木2-1-13 六本木MYビル1F
対象年齢: 小中学生（高校生は通信制高校の提携施設として対応）
料金: 要お問い合わせ
六本木一丁目駅から徒歩4分。学校に行きづらい児童・生徒のための「居場所」で、開室は平日10:00〜15:00です。小中学生はフリースクールとして、高校生は第一学院高等学校の提携施設として使えるので、進学後の居場所も見通せます。
近隣の選択肢（品川区）
港区は南北に長く、高輪・港南エリアからは品川区の施設も通いやすい距離です。2か所紹介します。
ATLAS International School 五反田校（品川区）
ATLAS International School 五反田校
運営: 特定非営利活動法人iプロジェクト
所在地: 品川区東五反田2-8-8 FLEZIO五反田4階（初等部）、東五反田5-27-5 ファイブセントラルビル3階（中等部）
対象年齢: 小学1年生〜中学3年生
料金: 要お問い合わせ
NPO法人が運営する五反田駅近くのフリースクール。各学年8〜12人の少人数制で、初等部と中等部が分かれています。都の助成対象一覧にも掲載されています。
ATLAS International School 五反田校（品川区）の公式サイト
明光フリースクール 大岡山校
明光フリースクール 大岡山校
運営: 株式会社明光みらい
所在地: 大田区北千束1-51-6 サンルミナス2F
対象年齢: 不登校の小中学生
料金: 週1回20,000円から
明光義塾がつくる小中学生対象のフリースクール。明光義塾の個別指導の考え方がベースになっていて、一人ひとりに寄り添った運営が特徴です。プログラミングやeスポーツといった新しい学び、体験ができる子どもたちの居場所です。
東急目黒線・大井町線の大岡山駅から徒歩2分で、港区の白金・高輪方面からも目黒線で通いやすい立地です。開校からまもないため都の対象施設一覧にはまだ掲載されていませんが、学校の出席扱いや東京都の助成金の対象になった実績があります。
なお、この記事を掲載しているメディアは明光フリースクールが運営しています。自社の施設なので詳しく書けている部分がありますが、順位づけの意図はありません。校舎の詳細や見学の申し込みは校舎ページからどうぞ。
公式サイト: 明光フリースクール
フリースクール かなめのもりのがっこう（品川区）
かなめのもりのがっこう
運営: 要お問い合わせ
所在地: 品川区荏原3-5-4 かなめのもりのビル203
対象年齢: 小学4年生〜18歳
料金: 月額29,700円（入会金0円キャンペーンあり）
武蔵小山駅から徒歩8分。平日10:00〜14:50に開所しています。追加費用のかからない月額固定制で、費用の見通しを立てやすいのが特徴です。
フリースクール かなめのもりのがっこう（品川区）の公式サイト
掲載していない施設について
港区内には、このほかにも公式サイトで詳細が確認できなかった施設や、活動を休止している施設があります。新設や移転で情報が変わることもあるため、通う前に必ず公式サイトと直接の問い合わせで最新情報を確認してください。
東京都全体から探したい方は、都内の市区町村別の一覧記事もあわせてどうぞ。
>>東京都のフリースクールと補助金一覧。市区町村別に紹介します【2026年最新】
掲載のない地域にお住まいの場合も、オンラインフリースクール「クラスジャパン小中学園」なら地域を問わず自宅から利用できます。
ネットの先生（担任）が伴走し、一定の要件を満たせば在籍校の出席扱いになった実績も多数あります。
2018年の開校から、これまでに2000人以上の不登校の子どもたちをサポートしてきました。
まとめ。合うか合わないかで選んでいい
フリースクールは優劣で選ぶものではなく、その子に合うか合わないかで選ぶものです。雰囲気も規模も方針も施設ごとにまったく違うので、気になったところを2〜3か所見学して、比べてから決めて大丈夫です。複数を並行して検討することも、途中で変えることも、何もおかしくありません。
今日できる一歩をひとつ提案します。気になった施設をひとつ選んで、公式サイトの問い合わせフォームから「見学はできますか」とだけ送ってみてください。港区の場合は、見学と同時に都と区の助成金のページをブックマークしておくと、入会後の申請がスムーズです。
お子さんを責める必要も、ご自身を責める必要もありません。今日からできる小さな一歩を、一緒に探しましょう。
よくある質問
港区にフリースクールはいくつありますか？
東京都の令和7年度フリースクール等利用者支援事業の対象施設一覧には、港区内の施設が6件掲載されています。この記事ではそのうち公式サイトで現在の運営を確認できた施設を中心に、区内5か所と品川区の2か所を紹介しています。
港区でフリースクールの利用料の補助はありますか？
あります。東京都の助成で補助金として月2万円まで、さらに港区の独自助成で月2万円まで上乗せされ、あわせて補助金として最大で月4万円まで支給されます。区の助成は都の交付決定を受けた区内在住の方が対象です。
フリースクールに通うと学校の出席扱いになりますか？
在籍校の校長が認めれば、指導要録上の出席扱いになりえます。文部科学省が通知で要件を示しており、学校とフリースクールの連携などがポイントです。港区での実例と手続きは本文で紹介した記事で解説しています。
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