子どもが学校に行けなくなったとき、多くの保護者の方が気になるのが「このまま欠席が積み重なって、進路に影響しないだろうか」という不安ではないでしょうか。
結論から言えば、学校に登校しなくても、フリースクールや自宅での学習を在籍校の「出席」として認めてもらえる制度があります。 そして長崎市には、すでにその承認事例があります。
長崎市は、教育委員会が保護者向けの資料のなかで、フリースクールなどの学校外施設について「学校以外の場所での活動を、学校が積極的に認めていくことができるようにしています」と書いている街です。出席扱いの相談は、市の方針に沿った話として切り出せます。
この記事では、長崎市で出席扱いを進める手順、市と長崎県の考え方、学びの支援センター「ひかり」やメタバース登校、補助金の状況までをまとめてお伝えします。
自己紹介が遅れました。小幡和輝と申します。僕は不登校の元当事者です。約10年間学校に行かず、フリースクールで学びました。現在は不登校の専門家として、本の執筆や講演をしながら、2000人以上の子どもたちとご家庭をサポートしています。
長崎市で実際に出席扱いが認められた事例
まず知っていただきたい事実からお伝えします。
長崎市内の学校で、フリースクールに入会したあとすぐに活動レポートを学校へ提出することで、出席扱いが認められた事例があります。
「うちの子の学校でも認めてもらえるのだろうか」と不安な方は多いと思います。ただ、長崎市にはすでに前例があります。前例があるということは、学校側にとっても判断しやすいということです。
そもそも「出席扱い」とは
出席扱いとは、学校に登校していなくても、自宅やフリースクールでの学習を在籍校の出席として認めてもらえる制度です。文部科学省が要件を示しており、最終的には在籍校の校長先生が判断します。[1]
ポイントは大きく4つあります。
- 保護者と学校の連携 担任の先生と定期的にやりとりできている状態が前提になります。
- 計画的な学習プログラム ICT教材やフリースクールでの活動がこれにあたります。
- 訪問等による対面指導 自宅で学ぶ場合は、先生の家庭訪問や面談など、対面のやりとりが定期的にあることが求められます。
- 学習状況の把握 活動レポートや学習記録を提出し、学校が状況をつかめるようにします。
つまり「なんとなく家で勉強している」ではなく、記録を残して学校と共有し、先生とも顔を合わせる仕組みさえあれば、出席扱いは十分に目指せます。申請すれば必ず認められるものではなく、校長先生がお子さんの状況を見て判断する、という点だけは押さえておいてください。
長崎市と長崎県は、学校の外の学びをどう位置づけているか
出席扱いを相談するとき、「市や県がどう考えているか」を知っていると、先生との話が進めやすくなります。長崎市には、根拠として使える材料が2つあります。
長崎市の資料「多様な学びの場や支援の仕組み」
長崎市教育委員会の教育研究所は、不登校の支援をまとめた保護者向けの資料を公開しています。令和8年度版では、学校の外の支援として、保護者座談会、学びの支援センター「ひかり」、学校外施設、メタバース登校、学びの多様化学校の5つが並んでいます。[2]
注目してほしいのは「学校外施設」の欄です。フリースクールや放課後等デイサービスを例に挙げたうえで、「民間施設と学校、教育委員会が連携することで、学校以外の場所での活動を、学校が積極的に認めていくことができるようにしています」と書かれています。
市のページにも、教育研究所が「フリースクール等の学校外施設と電話や訪問により積極的な連携を進めています」とあります。フリースクールで学ぶことは、市の支援の枠の外にある特別な選択ではありません。市が自分たちの資料に載せている選択肢のひとつです。
ただし、これは「フリースクールに通えば自動的に出席になる」という意味ではありません。判断するのは在籍校の校長先生で、学校と施設と保護者が情報を共有できていることが前提になります。資料の最後にも「学校としっかり話し合うことが大切です」と添えられています。
長崎県の「不登校支援コンセプト」
長崎県教育委員会は、教職員向けに「長崎県不登校支援コンセプト」の基本編と実践編を出しています。令和7年2月の実践編に、出席扱いについての記述があります。[3]
- 出席扱いの考え方 自宅でICT等を活用して学んだ場合や、教育支援センター、フリースクール等へ通っている場合に、一定の要件を満たせば、学校長が指導要録上の出席扱いとすることができる。
- 情報共有の体制 学校、教育委員会、保護者、関係機関等が情報共有できる体制を構築することが大切である。
県内の先生が読む手引きに、フリースクールも自宅でのICT学習も、出席扱いの対象になりうると書かれているわけです。担任の先生に相談するとき、「県の不登校支援コンセプトにも書かれている形で相談したい」と伝えると、話の土台が共有しやすくなります。
保護者の側でできる準備は、2つ目の「情報共有の体制」を先につくっておくことです。フリースクールを見学するときに「学校への報告は月に何回、どんな形で出してもらえますか」と聞いてみてください。ここに具体的に答えられるところなら、学校との話も進めやすくなります。
なぜ出席扱いが重要なのか
第一に挙げられるのは、進学や受験への影響です。欠席日数が内申に響くのではないかという不安は、多くの保護者の方が抱えるものだと思います。
ただ、この影響は昔に比べると小さくなってきています。受験の合否判定で出席日数を考慮しない自治体が増えてきているためです。
だからこそ僕は、もうひとつの視点をお伝えしたいです。
僕自身、不登校の当時はフリースクールに通っていた当事者です。当時は、学校に行っていない自分への否定的な気持ちや「このままでいいのかな」という不安がずっと心のどこかにありました。
でも、フリースクールでの学びが出席扱いになったことで、自分がやっていることを学校が認めてくれた。 「これでいいんだ」と思えるようになったんです。その結果、少しずつ自己肯定感が高まっていきました。
出席扱いは、単に欠席日数を減らすための制度ではありません。学校の外での学びも認められているという安心感を子どもに届けられる制度です。だからこそ僕は、出席扱いを大事にしてほしいと思っています。
出席扱いの仕組みを持つオンラインフリースクールについては、こちらで学び方を紹介しています。
長崎市での進め方。実例ベースの4ステップ
実際に承認された事例をもとに、流れを整理します。
- フリースクールや教材を決める 出席扱いの実績があるところを選ぶと話が早く進みます。学校への説明資料や連携の型をすでに持っているためです。学校への報告を定期的に出してもらえるかどうかも、ここで確かめておきます。
- 担任の先生に相談する 「出席扱いにしてほしい」といきなり交渉するのではなく、「文科省の通知に沿って、フリースクールでの活動を出席扱いにできないか相談したい」と伝えるのがスムーズです。判断するのは校長先生なので、担任の先生経由で話を上げてもらいます。
- 活動レポートを提出する 長崎市の事例では、入会後すぐにレポートの提出を始めたことが承認の決め手になりました。学習内容や時間、お子さんの様子が伝わることで、先生も安心して判断できます。
- 出席扱いが承認される その後も定期的にレポートを共有し、学校との連携を続けていきます。年度が替わって担任の先生や校長先生が交代したときは、あらためて経緯を伝えておくと安心です。
長崎市の場合、「ひかり」もメタバース登校も、利用するときは学校と教育研究所への相談が必要とされています。
つまり、市の支援を使うにしてもフリースクールを使うにしても、入口は同じ「学校への相談」です。
両方を考えているご家庭は、担任の先生への相談を1回にまとめてしまうと、学校側も全体像をつかみやすくなります。
レポートに何を書けばいいかは、こちらの記事で具体的にまとめています。
>>出席扱いに必要な学習記録はどう書く？学校に渡す内容と、親が書かなくて済む仕組み
もし学校の反応が鈍かったときの動かし方は、こちらの記事にまとめています。
>>出席扱いを学校に断られたときはどうする？校長判断を動かす3つの材料
長崎市のフリースクール補助金はどうなっているか
お金の面も正確にお伝えします。
2026年9月時点で、長崎市の公式サイトでは、フリースクールの利用料を保護者に補助する市独自の制度は確認できませんでした。長崎県にも、保護者へ利用料を直接助成する制度は確認できていません。県内のほかの市町でも、公式に確認できる制度は見つかりませんでした。
全国では、利用料の補助として最大で月1万円から2万円までを出す自治体が増えています。長崎市でも今後新設される可能性はあるので、最新の状況は教育委員会の教育研究所（095-824-4814）に確認してください。
補助金がないぶん、長崎市では「無料で使える公的な支援」と「費用を抑えやすいオンライン」をどう組み合わせるかが現実的なテーマになります。このあと順番に紹介します。長崎県内のフリースクールの全体像は、こちらの記事にまとめています。
>>長崎県のフリースクールと補助金一覧。市区町村別に紹介します【2026年最新】
長崎市で利用できる2つの選択肢
選択肢1：自宅で学べる「オンラインフリースクール」
「まだ外に出るエネルギーがない」というお子さんには、オンラインフリースクール「クラスジャパン小中学園」という選択肢があります。
自宅にいながら、ネットの先生（担任）が伴走し、学習や生活リズムをサポートします。
2018年の開校からこれまでに2000人以上の不登校の子どもたちを支えてきた実績があり、一定の要件を満たし校長先生が認めれば在籍校の出席扱いとなる仕組みも整っています。
出席扱い制度はクラスジャパンが先駆けとなって学校や自治体と一緒につくってきた取り組みなので、学校との連携もスムーズです。
長崎市は坂の街です。斜面に住宅地が広がり、合併で外海や琴海、野母崎、伊王島や高島まで市域に入りました。「ひかり」があるのは中心部の魚の町なので、バスを乗り継いで通うだけで負担になるご家庭もあります。自宅から始められるオンラインなら、住んでいる地区に関係なく同じ支援を受けられます。
学習面では最先端のAIサポートを取り入れているのも特徴です。生徒一人ひとりにカスタマイズされた学習AIが、わからない場面で答えをすぐに教えるのではなく、ヒントを出しながら一緒に考えてくれます。学習以外の用途には使えないフィルタリング設定があるので、安心して使えます。
選択肢2：仲間と過ごせる「明光フリースクール」
外に出て仲間と過ごしたいお子さんには、明光義塾がつくる明光フリースクールがあります。2026年9月時点で長崎県内に校舎はまだありません。東京・岡山・山梨などで校舎を運営していて、九州では福岡市で開校を準備しているところです。
長崎市から毎日通う距離ではないので、長崎市のお子さんにはまずオンラインのクラスジャパン小中学園をおすすめしています。
明光フリースクールでは、学び直しのサポートに加えて、プログラミングやeスポーツなど、子どもが「楽しい」と思えるコンテンツを用意しています。学校ではないけれど、仲間と過ごしながら通う場所として機能します。学校の出席扱いや自治体の補助金の対象になった実績も他の地域で多数あります。
新規の校舎もどんどん展開していますので、お近くの教室についてはまずはお問い合わせください。
長崎市の公的な相談窓口も知っておこう
フリースクールとあわせて、長崎市の公的な支援も知っておくと安心です。
長崎市学びの支援センター「ひかり」
長崎市の適応指導教室（教育支援センター）にあたるのが、長崎市学びの支援センター「ひかり」です。場所は長崎市民会館の7階（魚の町5-1）で、電話は095-825-2932（教育研究所 学びの多様化推進係）です。
市の資料では「学校に行きたい気持ちはあるけれど、なかなか登校できない子どもたちが、自分のできることにチャレンジしながら、エネルギーを高めていくところ」と説明されています。
集団と個別の両方で相談・指導を行い、小集団での体験学習もあります。市のページには、交流会やペンギン水族館、歴史文化博物館の見学の様子が載っています。
通うのが難しい子には、オンラインや家庭訪問での相談支援も行うとされています。利用するときは、学校と教育研究所への相談が必要です。
長崎県教育委員会は、県内の教育支援センターについて「出席扱いとなる」と説明しています。一方で、開室の曜日や時間、費用は市のページには書かれていません。相談のときに、在籍校での出欠の扱いとあわせて確認してください。
長崎市教育研究所「長崎市の不登校支援」（学びの支援センター「ひかり」）の公式ページ
長崎市メタバース登校
家から出るのが難しく、学校や支援機関の支援を定期的に受けられていない子を主な対象に、長崎市は令和7年6月から「メタバース登校」を始めました。仮想空間で、交流や面談、学びの場を提供する取り組みです。
対象は、長崎市立の小中学校に在籍する小学4年生から中学3年生の不登校の児童生徒です。毎週火曜日と木曜日の午前中に開かれていて、自分のペースで参加できます。令和8年度は4月23日に始まりました。登録は随時で、希望するときは学校に相談します。
>>小学生の不登校は約43人に1人｜低学年・高学年で違う原因と、親ができる7つの対応【2026年最新】
学びの多様化学校「のぞみ教室」
令和8年4月、長崎市民会館の2階に、長崎市立桜馬場中学校分教室「のぞみ教室」が開室しました。不登校の生徒の実態に配慮した特別の教育課程を組める「学びの多様化学校」です。対象は中学生です。
入室は前期（4月）と後期（10月）の年2回が予定されています。在籍校と教育研究所への相談、保護者向け説明会や体験入室への参加、転校の手続きが必要です。令和8年度後期の説明会は6月10日が申込の締切でした。令和9年4月入室の案内は、令和8年10月以降に市から出る予定とされています。
保護者座談会と不登校支援スクールカウンセラー
保護者のための場もあります。臨床心理士をコーディネーターに迎えた「保護者座談会」が、原則として毎月第4木曜日の10時から12時に市民会館で開かれています（7月・12月・3月は第3木曜日）。不登校の子を持つ保護者同士で、情報交換をしたり、不安や悩みを共有したりできます。
教育研究所には「不登校支援スクールカウンセラー」も配置されています。学校でのカウンセリングのほか、家庭訪問や関係機関での相談にも対応しています。どこから手をつければいいかわからない段階なら、教育研究所（095-824-4814）への電話が入口になります。
教育支援センターの通い方や費用の考え方、メタバース登校の仕組み、長崎県内の相談窓口は、それぞれこちらの記事で詳しく紹介しています。
>>教育支援センター(適応指導教室)とは？通い方・費用・出席扱いをわかりやすく解説
>>メタバース登校とは？自治体の仮想空間と、担任がつくオンラインフリースクールの違い
>>長崎県の不登校相談窓口一覧。無料で頼れる公的・民間の相談先【2026年最新】
公的な教室とフリースクールは、どちらかを選ばなければいけないものではありません。お子さんの状態や相性に合わせて、複数の選択肢を並行して検討してみてください。
まとめ。長崎市は「前例」と「市・県の方針」がそろっている
出席扱いは校長先生の判断で決まるため、前例があるかどうかが大きく影響します。長崎市にはすでに承認事例があります。
市の資料には、学校以外の場所での活動を学校が積極的に認めていけるようにすると書かれ、県の不登校支援コンセプトには、一定の要件を満たせば学校長が出席扱いにできると書かれています。
保護者向けの補助金は確認できませんでしたが、相談の土台になる材料はそろっています。
今日できる一歩として、連絡帳や学校への連絡メールに「学校の外で学べる場所を考えている。出席扱いにできないか、一度相談したい」と一文書いてみてください。「ひかり」やメタバース登校も気になっている方は、同じ連絡のなかで「市の支援のことも聞きたい」と添えておくと、話が1回で済みます。
学校に行かない期間があっても、学びと出席の心配を減らす方法はあります。お子さんを責める必要も、ご自身を責める必要もありません。僕の公式LINEでは不登校に関する情報発信や無料相談を行っています。今日からできる小さな一歩を、一緒に探しましょう。
よくある質問
長崎市で不登校の出席扱いは認められますか？
長崎市内の学校で、フリースクール入会後すぐに活動レポートを学校へ提出することで出席扱いが認められた事例があります。文部科学省の通知に沿って、最終的な判断は在籍校の校長先生が行います。
長崎市教育委員会の資料にも、民間施設と学校、教育委員会が連携して、学校以外の場所での活動を学校が積極的に認めていけるようにすると書かれています。まず担任の先生に相談し、校長先生に話を上げてもらう流れが基本です。
長崎市にフリースクールの補助金はありますか？
2026年9月時点で、長崎市の公式サイトでは保護者向けにフリースクールの利用料を補助する市独自の制度は確認できませんでした。長崎県にも保護者へ直接助成する制度は確認できていません。
制度は年度で変わるため、最新の状況は長崎市教育委員会の教育研究所（095-824-4814）に確認してください。
学びの支援センター「ひかり」やメタバース登校など、市の公的な支援とオンラインを組み合わせる方法があります。
長崎市の適応指導教室（教育支援センター）はどこにありますか？
長崎市学びの支援センター「ひかり」が、長崎市民会館の7階（魚の町5-1）にあります。
集団と個別での相談・指導や体験学習があり、通うのが難しい子にはオンラインや家庭訪問での相談支援も行われています。
利用するときは学校と教育研究所への相談が必要で、問い合わせ先は教育研究所の学びの多様化推進係（095-825-2932）です。
出典
- 文部科学省「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」（令和元年10月25日） ページ 本文へ戻る
- 長崎市教育委員会 教育研究所「R8多様な学びの場や支援の仕組み」 PDF 本文へ戻る
- 長崎県教育委員会「長崎県不登校支援コンセプト（基本編・実践編）」（実践編は令和7年2月） ページ 本文へ戻る
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