大分県でフリースクールを探している方へ。お子さんが学校に行かない日が続くと、「通える場所は近くにあるのか」「費用はどのくらいかかるのか」と、調べることが次々に出てきて疲れてしまいますよね。大分県はフリースクールが大分市に集中していて、それ以外の市町村は情報が少ないので、探すだけでもひと苦労だと思います。
この記事では、大分県のフリースクールを市町村ごとに1か所ずつ、順位づけなしで紹介します。あわせて、別府市と日田市で使える利用料の補助金、県が令和7年度に始めたフリースクール認証制度、出席扱いの仕組みについても、公式の情報をもとにまとめました。
自己紹介が遅れました。小幡和輝です。約10年間の不登校を経験し、当時の僕を支えてくれた場所がフリースクールでした。いまはそれを運営する側として、本を書いたり、2000人以上の子どもたちとご家庭に関わっています。
大分県のフリースクールの状況
文部科学省の令和6年度調査によると、大分県の小中学生の不登校は1,000人当たり36.9人で、全国平均の38.6人に近い水準です。1クラスに1人以上いる計算なので、学校に行かない子は大分県でも決して珍しくありません。
出典: 文部科学省「児童生徒の問題行動・不登校等生徒指導上の諸課題に関する調査」
児童生徒の問題行動・不登校等生徒指導上の諸課題に関する調査の公式ページ
大分県は、フリースクールの情報公開が比較的進んでいる県です。県教育委員会が公式サイトで県内のフリースクール等の一覧を公開しており、2026年9月時点で23施設が掲載されています。2016年（平成28年）12月には全国的にも珍しい「大分県フリースクールガイドライン」を作成し（令和7年4月に改訂）、令和7年度からは一定の基準を満たした施設を県が認証する「フリースクール等認証制度」も始まりました。
- 大分県内フリースクール一覧: 大分県のフリースクールの状況の公式ページ
- 大分県フリースクールガイドライン: 大分県のフリースクールの状況の公式ページ
利用料の補助金は、県レベルの保護者向け助成は公式に確認できませんでしたが（2026年9月時点）、市の制度が2つあります。
- 別府市 フリースクール等利用児童生徒支援補助金。利用料の4分の3（生活保護・就学援助の受給世帯は全額）を、月額30,000円を上限に補助します。学校との情報共有への同意などが要件です。 別府市の公式ページ
- 日田市 フリースクール利用料補助金。市教育委員会が認定したフリースクールに原則週1回以上通う場合に、利用料の2分の1・月額上限15,000円（生活保護・就学援助世帯は全額・月額上限30,000円）を補助します。 日田市の公式ページ
いずれも年度によって内容が変わることがあるので、最新情報は各市の公式ページでご確認ください。フリースクールの費用相場や補助金の全国的な動きは、こちらの記事で詳しく解説しています。
>>【小中学生向け】フリースクールの費用相場はいくら？補助金や後悔しない選び方まで解説
フリースクールでの学びが出席扱いになる仕組み
フリースクールでの学びは、一定の要件を満たせば在籍校の指導要録上「出席扱い」になります。文部科学省が通知で示している全国共通の仕組みで、在籍校の校長が判断します。
出典: 文部科学省「不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）」
不登校児童生徒への支援の在り方について（通知）の公式ページ
大分県はガイドラインや認証制度を通じて、学校とフリースクールの連携を県として後押ししています。日田市の補助金のように、認定フリースクールと学校が情報を共有することを前提にした制度も生まれています。もし学校に相談して断られてしまった場合の進め方は、こちらの記事にまとめています。
>>出席扱いを学校に断られたときはどうする？校長判断を動かす3つの材料
まだ外に出るのが難しい、近くに通える場所がないという方へ
このあと紹介するとおり、大分県のフリースクールは大分市に集中していて、公式に確認できた施設がある市は8つにとどまります。竹田市や豊後高田市、国東半島など、通える範囲にフリースクールがない地域は実際にあります。それはご家庭の努力不足ではありません。
また、通える場所があっても、家から出るエネルギーがまだ戻っていない時期もあります。週に何日も車で送り迎えが必要となると、続けること自体がハードルになる場合もありますよね。
そういうときの選択肢として、オンラインフリースクール「クラスジャパン小中学園」があります。ネットの先生（担任）が伴走してくれて、自宅から自分のペースで学べます。2018年の開校から、これまでに2000人以上の不登校の子どもたちを支えてきました。一定の要件を満たせば在籍校の出席扱いになる仕組みも整っています。学習では、AIがヒントを出しながら一緒に考えてくれて、学習以外に使えないフィルタリング設定があるので、ゲームばかりにならないか心配な方も安心です。
詳しくはこちら: クラスジャパン小中学園
大分県のフリースクール（市町村別）
市町村ごとに1か所ずつ紹介します。順位をつけたものではありません。いずれも公式サイトや県の公式一覧で実在を確認した施設です。料金や対象は変わることがあるので、必ず最新情報をご確認ください。
大分市
志塾フリースクール おおいた教室
運営: NPO法人志塾フリースクール
所在地: 大分市日吉町2-19
対象年齢: 要お問い合わせ
料金: 要お問い合わせ
1997年に大阪で始まり、京都・岡山・鳥取・島根・沖縄など全国に教室を展開する志塾フリースクールの大分教室です。不登校や発達障がい、いじめなどの悩みに寄り添う方針で、県の公式一覧にも掲載されています。見学・体験を受け付けています。
別府市
みんなの教室
運営: 特定非営利活動法人みんなの教室
所在地: 別府市上田の湯町14-6
対象年齢: 要お問い合わせ
料金: フリースペース1日3,000円、クラス1コマ1,000円（入会金5,000円。初回の体験と見学は無料）
2020年6月に設立された、別府市で最初のフリースクールです。自分の「やりたいこと」がカリキュラムという方針で、教育委員会や学校とも連携しています。子ども食堂や家庭訪問での1対1サポートもあり、先ほど紹介した別府市の補助金と合わせて検討しやすい環境です。
中津市
こまどぷらす（KOMADO STREET）
運営: 特定非営利活動法人まど
所在地: 中津市上宮永395
対象年齢: 要お問い合わせ
料金: 要お問い合わせ
発達障がいや不登校の子ども・若者を長年支援してきたNPO法人まどが、複合型の居場所「KOMADO STREET」で開いているフリースクール・学習支援です。不登校やひきこもりの相談支援窓口も同じ建物にあり、県の公式一覧にも掲載されています。
日田市
フリースクールあさひ
運営: 一般社団法人フリースクールあさひ
所在地: 日田市小迫町1301
対象年齢: 要お問い合わせ
料金: 要お問い合わせ
2020年に開設された日田市のフリースクールで、学習支援や体験活動、相談活動を行っています。開室は月・水・金曜の9時30分〜15時30分です。日田市には利用料補助の制度があるので、対象になるかどうかも含めて市教育委員会と施設に確認してみてください。
佐伯市
未来学園 佐伯校
運営: 要お問い合わせ
所在地: 佐伯市駅前1-6-38
対象年齢: 中学生
料金: 月額22,000円（利用日・利用回数は自由）
平成31年4月に開校した、フリースクールと通信制高校サポート校を併設する学びの場です。フリースクールから高校卒業まで一貫したサポートを受けられるのが特徴で、大分市金池町にも校舎があります。JR佐伯駅前という通いやすい立地です。
臼杵市
フリースクールぱずる
運営: 要お問い合わせ
所在地: 臼杵市臼杵2-107-42
対象年齢: 要お問い合わせ
料金: 要お問い合わせ
臼杵の城下町エリアにあるフリースクールで、大分県教育委員会の公式一覧に掲載されています。公式サイトがないため、詳細は直接のお問い合わせで確認してください。臼杵市には教育支援センター「きずな」（無料）もあるので、並行して検討できます。
掲載元（県の公式一覧）: 臼杵市の公式ページ
宇佐市
おおいたうさフリースクール夢の星
運営: 要お問い合わせ
所在地: 宇佐市上田1770-1
対象年齢: 小学生・中学生
料金: 月額20,000円（入校前に1か月間の無料お試し期間あり）
不登校の小中学生のための居場所で、同じ拠点に通信制高校のキャンパスを併設しているため、高校進学までの道筋を描きやすいのが特徴です。世帯の年収に応じて学費を減額する返済不要の「夢の星奨学金」制度もあります。
豊後大野市
ここのね自由な学校
運営: 認定NPO法人ここのね
所在地: 豊後大野市大野町田中2400
対象年齢: 小学1年生〜中学3年生
料金: 選べる通学型は週1回で月13,200円（入学金30,000円）、全日制は月42,000円（入学金100,000円）
「暮らしを楽しむ」「好きを極める」「対話で分かち合う」を掲げるオルタナティブスクールです。全日制のほか週1〜2回の通学型、年長から参加できる月1回の「おしえない学校」もあり、通う頻度を子どもに合わせて選べます。無料の見学から始められます。
掲載していない市町村について
津久見市・竹田市・豊後高田市・杵築市・由布市・国東市・日出町・九重町・玖珠町・姫島村は、公式サイトや公的資料で内容まで確認できる通所型のフリースクールが今回見つかりませんでした。掲載がないことは「何もない」という意味ではありません。新設や移転で情報は変わるので、通う前には必ず公式サイトと直接の問い合わせでご確認ください。
また、どの市町村にも公的な選択肢として教育支援センター（適応指導教室）があります。由布市の「コスモス」や豊後高田市の「ビリーブ」、杵築市の「ひまわり」など無料で利用できる場所が整備されているので、まずはお住まいの市町村の教育委員会に相談してみてください。
フリースクールが近くにない地域での学びの確保については、こちらの記事でも詳しく解説しています。
>>フリースクールが近くにない地域での選択肢。通わずに学びと出席扱いを確保する方法
掲載のない地域にお住まいの場合も、オンラインフリースクール「クラスジャパン小中学園」なら地域を問わず自宅から利用できます。ネットの先生（担任）が伴走し、一定の要件を満たせば在籍校の出席扱いになった実績も多数あります。2018年の開校から、これまでに2000人以上の不登校の子どもたちをサポートしてきました。
クラスジャパン小中学園
他の都道府県をお探しの方へ
全国47都道府県のフリースクールと補助金の一覧は、こちらのまとめからご覧いただけます。
>>【全国版】47都道府県のフリースクールと補助金一覧。お住まいの県から探せます【2026年最新】
まとめ。合うかどうかで選んで大丈夫です
フリースクールは、優劣ではなく「その子に合うかどうか」で選ぶ場所です。体験や見学をしてから決めていいですし、複数の場所を並行して検討してもかまいません。大分県は県の一覧やガイドラインが整っているぶん、候補を絞り込みやすい環境です。お子さんが「ここなら行ってもいいかな」と思える場所を、あせらず選んでください。
今日できる一歩をひとつ提案します。別府市・日田市にお住まいなら、市の補助金ページを開いて対象要件を確認してみてください。それ以外の地域の方は、気になった施設に「見学だけでもいいですか」とメールか電話で聞いてみてください。お子さんを連れて行くのは、保護者の方が下見をしてからで大丈夫です。
完璧な正解を最初から選ぶ必要はありません。迷っている段階の相談こそ歓迎です。ひとりで抱え込む前に、話してみてください。
よくある質問
大分県にフリースクールはいくつありますか？
大分県教育委員会が公式サイトで公開している一覧には、2026年9月時点で23施設が掲載されています。ただし大分市に集中しており、通いやすい範囲にあるかは地域差が大きいのが実情です。通信制高校の中等部など運営形態もさまざまなので、県の一覧とこの記事を手がかりに、公式サイトで最新情報を確認してください。
大分県でフリースクールの利用料の助成はありますか？
県レベルの保護者向け助成は公式に確認できませんでしたが（2026年9月時点）、別府市が利用料の4分の3・月額上限30,000円（生活保護・就学援助世帯は全額）、日田市が利用料の2分の1・月額上限15,000円（生活保護・就学援助世帯は全額・上限30,000円）を補助しています。要件や申請時期は各市の公式ページでご確認ください。
フリースクールに通うと学校の出席扱いになりますか？
一定の要件を満たせば、在籍校の校長の判断で指導要録上の出席扱いになります。文部科学省の通知に基づく全国共通の仕組みです。大分県はフリースクールガイドラインや令和7年度に始まった認証制度で学校との連携を後押ししているので、通いたい施設が決まったら、早めに在籍校と教育委員会に相談するのがスムーズです。
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